El CET-CIRM es un espacio académico que apoya, en fidelidad al Magisterio de la Iglesia, el servicio de formación de la CIRM. En él se promueve y realiza el diálogo multidisciplinar entre la teología, la filosofía, la vida religiosa y la realidad socio cultural, particularmente la mexicana, por medio de cursos, talleres, ciclos de conferencias, simposios, paneles y otros. De manera específica, el Instituto plantea los siguientes objetivos:

1. Afirmar en y desde la vida religiosa la presencia eficaz de la teología y su diálogo con las culturas que están en la base de la mexicanidad.
2. Fundamentar desde la reflexión teológica la vida religiosa y sus diferentes expresiones carismáticas e institucionales.
3. Capacitar a las alumnas y alumnos para el servicio que exige la Nueva Evangelización.
4. Iluminar el papel de la vida religiosa en la Iglesia desde las orientaciones del Magisterio.
5. Promover la reflexión teológica desde una perspectiva multidisciplinar y difundirla en la Iglesia y en la sociedad.

El CET CIRM ofrece los medios necesarios para la obtención de una Licenciatura y un Diplomado en Ciencias Religiosas, cuyos objetivos específicos son:

1. Hacer presente la reflexión Teológica en la Iglesia local y en las comunidades religiosas donde viven y trabajan las alumnas y los alumnos del CET-CIRM.
2. El estudio de la teología de modo sistemático, orgánico y completo.
3. Capacitar para el diálogo multidisciplinar e interdisciplinar entre la teología, la filosofía perenne, el pensamiento religioso y otras disciplinas humanísticas.
4. Formar a las alumnas y alumnos para las exigencias y retos de la inculturación del Evangelio, en vistas a que las/os egresadas/os puedan dar una mejor respuesta a los cuestionamientos que la Iglesia y el mundo plantean a la Vida Religiosa en los albores del Tercer Milenio.
5. Hacer, a la luz del Magisterio de la Iglesia, una relectura crítica de la Tradición Cristiana referida especialmente a Latinoamérica
6. Proponer una reflexión teológica comprometida especialmente con la mujer, la vida religiosa femenina y la misión que ésta realiza en la Iglesia y en el mundo.
7. Capacitar a docentes en ciencias religiosas y a agentes de pastoral para el servicio de las comunidades religiosas y de las Iglesias locales.

El CET-CIRM tiene un convenio con la Universidad Iberoamericana que permite obtener, mediante el cumplimiento de algunos requisitos, la Licenciatura Civil.